玄妙宗身处卧仙山的中心，占据了最好最高的几座山峰，这家宗门创立于五千年前，差不多是大秦最古老的一批宗门，但真正的前身其实可以追溯到七千年前的那场两族大战上去，当时妖族兵锋南下，大半中州沦落，秦地自然也难逃此劫，有大批的修士百姓南下逃亡，他们互相结伴，组成或大或小的队伍，在艰难的乱世中讨生活，他们要防备的不仅仅是妖族，还有其它资源匮乏的队伍。
这些人一窝蜂地涌入南岭，那时的南岭比起今日来说更加荒凉，险地处处，外来者在此求生大有不易，很多修士不得不学些本地修士的手段，譬如如何祛除可怖的毒虫，如何驱逐弥漫数十里的瘴气，如何应付如鬼魅般在南岭各处游荡的神鬼修士。
他们很快学到了一些特殊的手段，其中最让他们受益匪浅的，便要数应对那些神鬼修士的方法。
所谓神鬼修士，其实是一种含混的称呼，这些修士无门有派，三三两两地聚集在一起，生活在南岭中最为偏僻和危险的地带，他们不信仙不尊帝，却信奉一些古老而神秘的神灵，或者是说不出来历的鬼怪，修炼的秘法也颇为诡异，诅咒、献祭、毒蛊，无所不精，尤其擅长灵魂大道，他们潜伏暗中，最喜欢对落单的修士出手，是让南下的中州修士最头疼的敌人。
现今的南岭，神鬼修士已经很少见了，一是因为战事告终，人族疆域平定，大大小小的宗门王朝在南岭各地如雨后春笋般出现，挤压了这些神鬼修士的生存空间，二是有一部分神鬼修士走出了生活数万年的山林，开宗立派，他们很有远见，在大批修士涌入南岭后，他们就意识到过去平静的生活已经消失了，索性走了出来，现今南岭有二成的宗门都是他们的后裔，比如颇为神秘的土行修，就是这些神鬼修士的一支。
但七千年前，玄妙宗的先祖在这些神鬼修士头上着实吃了不少亏，在死了不少同伴后，他们也开始学习南岭本地修士的手段，渐渐地开始将南岭的秘术与中州的功法融合，创造出了一种独特的流派，这便是玄妙宗的起源。
他们也擅长灵魂大道，但比起南岭修士直接操控灵魂，或邪恶或诡异的秘术来说，玄妙宗的道法要更加平和，他们会直接以神识大术攻击灵魂，也会以种种秘法挑动敌人的道心，喜怒哀乐，七情六欲，这是连修士也无法避免的东西。
随着战事平定，这些逃难的修士逐渐迁回南岭，但这一过程其实持续了一千多年，回到秦地的修士又在不断争斗，夺取想要的地盘，所以直到五千年前，玄妙宗才正式建立起来。
值得一提的是，枯剑山其实也是这些逃难修士的传人创建的，但比起玄妙宗更要晚了近两千年，他们花费了大量的精力融合剑道与灵魂大术，不过先祖毕竟同出一源，所以两宗天然相近，很早便站在一起，结成了盟友，同进同退。
所以玄妙宗其实和枯剑山一样，都很渴求国教这个位置，因为这对他们的修行很有好处。
不过自大秦建立以来，玄妙宗多次出手，却都没能得到这个位置。
所以现在，玄妙宗的心思有些复杂。
三座入云高山静静伫立，奇险俊秀，山上遍布楼宇瓦舍，自山脚下就有一股灵光氤氲而起，逐渐升腾，最终缭绕在山腰处，这是玄妙宗独有的景色，被称为玄妙霞光，据说是因为玄妙山下埋着一块灵石，吸收星月精华，每日晨起后光华自现，形成了这种独特的景色。
虽然秀美无双，但玄妙山上却一片压抑，无论是长老还是弟子，都有种风雨欲来的焦灼感，尤其是弟子们，他们的消息更少，绝大多数都是道听途说，所以不免有些失实，让枯剑山背叛玄妙宗，成为大秦国教的传闻甚嚣尘上，甚至有人慌张地猜测，枯剑山已经与大秦、赤霄殿联手，要将玄妙宗从第一宗门的位置上拉下来，取而代之。
一时间，人心惶惶，虽然有长老出面稳定人心，但连这些长老都摸不准现在的局势，所以难以服众，弟子们依旧有些不安。